政府协议供货采购的一般程序如下：
1、确定供应商：根据市场情况和实际需要，每年或每两年确定2-3家中标供应商、若干品牌，每一品牌确定若干系列的型号(技术规格)，保证采购人能在一定的范围内自主选择采购所需的商品品牌、型号和中标供应商。根据财政部和国家发展和改革委员会颁发的《节能产品政府采购实施意见》，应优先考虑采购节能产品。
2、实施采购：采购人根据财政批复的政府采购预算和政府采购网站公布的供应商各项具体承诺，直接与协议供货供应商接洽，确定需购买设备的品牌、机型、价格及售后服务条款等。公布的中标价格为最高限价，采购人应“货比三家”，充分比较各品牌设备的性能、服务，并对成交价格按不高于公布的中标价格商谈确定。采购单位和供货商签订《市政府采购协议供货合同》。合同文本分别由采购单位、供货商、政府采购中心留存，政府采购中心联由供应商于每月度结束后7个工作日内汇总报送政府采购中心审核确认。