党的基层组织是党的全部工作和战斗力的基础，党的农村组织是党在农村的战斗堡垒，是贯彻“三个代表”的组织者、推动者、实践者。进一步加强农村基层组织建设，特别是加强贫困山区农村党组织建设，既是当前建设新农村的需要，也是进一步提高农村基层组织建设整体水平的迫切任务。近年来，各个地方对农村基层党组织进行了整顿和建设，取得了明显成效。但是，用“三个代表”重要思想的标准来严格对照，绝大多数地方农村基层党组织建设依然存在着一些不足，特别是农村“两税”免征后，农村的党组织建设表现出了一些新问题，村干部“无事”现象较为严重。因此认真研究当前农村的党组织建设面临的新情况、新问题，积极探索农村基层党组织建设的新方法、新路子，显得尤为迫切和重要。
存在的难点
通过调查，综合分析当前贫困山区农村党组织建设存在的问题，具体表现为四大难点：
难点之一：班子缺乏战斗力，发展观念落后，工作职能转变难。
一是班子成员及党员队伍年龄老化、素质低化、作用弱化，缺乏战斗力。被重点调查的26个村86名村干部中， 35岁以下的只有17名，占总数的19.8%；60岁以上的就达28人，占32.5%；初中及以下文化的63人,占73.3%。其中有个别村，没有一个35岁以下的党员，不识字的党员达三分之一以上。二是村支两委班子弱，缺乏凝聚力，发展观念落后。调查中，自去年村级组织换届选举后，有几个村至今没有一个村干部真正管事，各行己事，一盘散沙，村里的各项工作处于瘫痪状态。用他们的话说，“不收税了，村里没有事可做。”95%的村支部一年到头，支部会都没有开过一次，对组织建设更是不闻不问。“收税干部”帽子紧贴心上，工作职能转变难。
难点之二：集体经济薄弱，资金严重缺乏，实事兴办难。
据调查，笔者所在市还有90%村集体经济为空白，导致村里正常的开支无法保证，“无钱办事”的问题日显突出，干部工作有心无力,实事兴办艰难。在笔者所调查的26个村中，只有4个村或多或少有一点集体收入，其它22个村均没有集体经济收入。
难点之三：热点问题多，各种矛盾大，建立良好的发展秩序难。
一是部分群众国家观念、集体观念淡薄，连公民的基本义务都不尽，村里工作难以推动。一些村干部反映，基础设施建设，诸如村道公路建设、农田水利建设等，动员大家投劳，拒不履行义务的农民总是大量存在，靠说服教育做思想工作难见成效，来点硬的又怕触及“高压线”，从而导致矛盾重重，工作无所适从。甚者有的农民故意出难题，找岔子，个别村民为非作歹，打击报复村干部，导致村干部不敢大胆开展工作，即使有一点信心，也会“龙起头蛇收尾”。三是部分卸任干部思想有情绪，对工作有一定阻力。有的村干部被免职后，心里总是不平衡，想不通，不但自己不配合村上的工作，并且还煽动群众与村上的工作顶着干，在群众中造成不良影响。四是热点难点问题多，矛盾难化解。广大基层党组织处在农村工作的最前沿，“上有千条线，下面一根针”，无论是党建、经济工作，还是计生、综治工作，到了基层，都是中心工作，都是硬任务，每项工作都松懈不得，加上山林水土纠纷等，农村工作可谓矛盾重重，但村干部权小位轻，对很多工作有心无力，推动不下，解决不了。
难点之四：工作环境差，社会待遇低，干部培养难。
一是农村工作难度大、矛盾多，现职干部感到工作压力大，不想当。当前农村工作各种压力大部分落到了村干部肩上，加之工作难度大，矛盾复杂，一些村干部因此产生了悲观心理，有打退堂鼓、不想干的念头，“做一天和尚撞一天钟”，抱着“守摊子”的思想。二是社会环境差，激励机制不够完善，大部分村干部感到工作没奔头，不愿当。首先政治上没奔头。不少村干部讲，“当了村支书，前面断了路”，因而在政治上失去了可追求的目标，工作积极性不高。其次经济上无甜头，生活上有后顾之忧。目前大部分村干部的报酬普遍偏低，处于一种高付出、低报酬的状态，致使村里一些有才有能的中青年农民宁愿外出务工经商或当平民，也不愿当村干部。三是后备干部成才困难，党员队伍出现后继乏人的危机。一方面受地理位置、经济条件的局限，一些村的年轻人尤其是经济能人外流严重,“难以培养”。有的村自然条件恶劣，村中大部分人口外出打工，剩下的不是老就是少，内选不出，外调不进，回请不来，下派的也干不长。另一方面部分现任支书“官本位”思想严重,“不肯培养”。这些村支书怕培养了别人会顶掉自己，有意无意地压制人才成长；还有的村支部党员内部闹派性，不同宗派的，千方百计设置障碍，对发展党员求全责备，把一些优秀的年轻人关在了“党门”之外。在调查的26个村中，大多数村几年未发展一个党员。由于平时村里没有注重培养后备干部，造成“人到用时方恨少”的局面。